Opa Lima, tudo bom ?
Cara, a menos que você tenha configurado algum caminho para a geração do arquivo .log que não exista no Server onde você vai fazer o deploy do seu WAR, eu não vejo porque que não funcionaria.
O ideal seria gerar esse arquivo em um caminho relativo (que creio que você já está fazendo).
Resumindo, se estiver configurado para caminho relativo e você não alterar as configs do Log4J, tudo dará certo sim.
Abs []
desculpem erro meu, o arquivo foi encontrado !